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育種界的 “高鐵” 來了！基因組選擇到底牛在哪？

發(fā)布時間：

2025-08-12

王立剛老師簡介

誼發(fā)牧業(yè) - 國家畜禽種業(yè)陣型企業(yè)

有人說，如果把育種技術(shù)帶來的遺傳改良速度與交通工具類比，古代的“相畜”和常規(guī)育種技術(shù)相當(dāng)于“馬車”和“蒸汽機車”，而基因組選擇則是“高鐵”。真的是這樣嗎？

先認識四個關(guān)鍵育種指標(biāo)

下面，我們就這個問題作個簡單說明。首先，大家先記下4個名詞：“綜合指數(shù)”、“基因組指數(shù)”、“常規(guī)育種值 ”、“基因組育種值”，我們的介紹主要針對這四個詞展開。

 

綜合指數(shù)和基因組指數(shù)差別在哪兒？

在評價一頭豬的時候，我們最常用的一個詞就是“綜合指數(shù)”是多少。這個指數(shù)究竟是怎么回事呢？這個指數(shù)實際上是我們幾個主選的性狀，像達120kg體重日齡、背膘、產(chǎn)仔數(shù)、料比、均勻度等的“育種值”各自乘以一個重要性（專業(yè)上稱為權(quán)重，一般是固定的）再相加起來形成的一個數(shù)字。這個過程涉及兩個步驟，先計算育種值，再將育種值相加合成一個指數(shù)。

不管我們的常規(guī)指數(shù)還是基因組指數(shù)，都是這樣。不同的是，常規(guī)綜合指數(shù)是先計算常規(guī)育種值再合成一個指數(shù)。基因組指數(shù)是先計算基因組育種值，再相加合成一個指數(shù)。

所以我們可以得出第一個結(jié)論，基因組指數(shù)和常規(guī)的綜合指數(shù)差別的實質(zhì),實際上是常規(guī)育種值和基因組育種值的差異。

 

常規(guī)育種值和基因組育種值差別在哪兒？

在計算常規(guī)育種值的時候，我們會用一個叫最佳線性無偏預(yù)測（BLUP）的方法。應(yīng)用這個方法，我們可以把場、年季、性別、測定儀器、胎次等的影響應(yīng)用一定的數(shù)學(xué)方法計算出來，然后根據(jù)系譜推算的遺傳關(guān)系，結(jié)合父母的性能“計算（估算）”出來每一頭豬能遺傳下去的性能值，這個值就是育種值。由于這個值是我們用數(shù)學(xué)方法（BLUP）估算出來的，所以育種值也叫估計育種值。

在計算基因組育種值的時候，我們會用一個叫一步法BLUP（ssGBLUP）的方法。這個方法與前面常規(guī)育種值估算方法不同的地方在于，在中間的計算過程中，我們不再只用系譜來推算遺傳關(guān)系了，而是用了系譜和基因組的信息來推算遺傳關(guān)系。這樣得到的育種值叫基因組育種值。

所以，我們可以得出第二個結(jié)論，常規(guī)育種值和基因組育種值的差別在于，在計算過程中一個只用了系譜信息，一個同時用了系譜和基因信息。

 

基因組育種值和基因組指數(shù)為什么更準(zhǔn)？

我們知道，同一窩豬的父母都一樣，所以在計算常規(guī)育種值的時候，同窩的豬的遺傳關(guān)系都是用的同一個。但是實際上，由于父母在給后代傳遞基因的時候，染色體會發(fā)生重組，給不同的兄弟傳下去不同的基因，所以父母一樣的兄弟的差別也會很大。這種重組也造成了兄弟間的真正的遺傳關(guān)系并不是完全一樣的。基因組育種是利用了基因的信息，算出來的遺傳關(guān)系更接近真正的遺傳關(guān)系。

所以，我們可以得出第三個結(jié)論，基因組育種值會更準(zhǔn)確。尤其是在早期選育的時候，沒有個體的性狀值，基因組育種值就會比常規(guī)育種值準(zhǔn)確很多?；蚪M育種值更能真實反映豬的育種值，基因組指數(shù)也更能真實反映豬的真實指數(shù)。

 

你可能關(guān)心的3個小問題

1．基因組選擇花的錢會不會很多錢？

由于要測定芯片，做基因組選擇每頭豬要多花150塊錢左右。由于可以進行早期選育早期閹割，所以對于育種場來說可以抵扣一些成本。就純育種場來說，這依舊是一種負擔(dān)。但是因為選得準(zhǔn)、進展快，自己的豬性能提高快更好賣的同時，也讓買豬客戶真正受益。

2. 由于資金有限，我的一些豬測了基因組，一些沒測，是不是就不能用了？

前面我們說過，基因組育種值在計算的時候同時用了系譜和基因的信息，這就使我們前期父母的育種值算的是更準(zhǔn)的，同胞的也是更準(zhǔn)的，自己得到的指數(shù)也是更準(zhǔn)的。短時間沒有做基因組，選出來的豬的育種值依舊是更準(zhǔn)的，是可持續(xù)的。

3. 基因組選擇時常聽說參考群和候選群，是什么？我想做基因組育種，需要多大的群體？

參考群，簡單說就是同時有性狀記錄又測了芯片的群體。侯選群是我們正常進行選種的個體。

正常情況下，對于日齡、背膘等，我們有1500頭的有性狀記錄又有芯片的群體，基因組育種值就會明顯比常規(guī)育種值準(zhǔn)確。對于產(chǎn)仔等，有3000頭的群體，基因組育種值就會明顯比常規(guī)育種值準(zhǔn)確。由于我們可以在計算的時候調(diào)整使用基因線信息的比例，所以即使群體比這個小，我們依然可以得到與常規(guī)育種值媲美的準(zhǔn)確性，群體0開始，我們也能做基因組選擇。